リコは、アビスの底にいる母ライザを探すため、ロボットの少年レグと深界へ向かう。途中で「上昇すると重い障害を受けるアビスの呪い」に苦しみ、ナナチと出会う。
ナナチとミーティは、探窟家ボンドルドの人体実験の犠牲者。ミーティは不死の異形となり、ナナチの願いでレグがとどめを刺す。その後、リコたちはボンドルドと戦い、彼の娘プルシュカも実験に利用されて死亡。プルシュカは白笛となり、リコの装備になる。
深界六層では、成れ果てたちの村「イルぶる」に到着。村は少女イルミューイの身体と願いから生まれた場所だった。ファプタはイルミューイの娘として村への復讐を果たし、村は崩壊。最後はファプタもリコたちの旅に加わる。